坚持“谁用人、谁受益、谁负责”和培养与使用并重的原则，由服务单位和服务县“三支一扶”办公室具体管理，省和市“三支一扶”办公室负责指导和协调。
户档管理
服务期间，“三支一扶”大学生户口保留在原学校管理，也可根据本人意愿将户口转至入学前户籍所在地，公安机关应按规定为其办理落户手续。人事档案统一转至服务单位所在县政府人事部门，党团组织关系转至服务单位。对服务期间积极要求入党的，由乡镇党组织按规定程序办理。
考核管理
县“三支一扶”办公室负责“三支一扶”大学生年度考核和服务期满考核工作；服务单位负责平时考核。其中对兼任乡镇团委副书记的大学生考核工作由县（市、区）团委会同乡镇党委进行。考核主要内容是“三支一扶”大学生的日常工作表现、服务业绩等。年度考核、服务期满考核材料存入本人档案，并将考核结果报省、市“三支一扶”办公室备案。服务期满考核合格的，经省“三支一扶”办公室审核，颁发由人事部统一印制的《高校毕业生到农村基层服务证书》，作为享受相关就业政策的依据。
“三支一扶”大学生应按规定完成服务工作，服务期间由于身体状况等特殊原因不能继续服务的，须经省“三支一扶”办公室批准，并履行有关手续。
日常管理
县级“三支一扶”办公室要负责生活补贴、交通补贴的发放，交纳保险费用，指导、协调服务单位落实“三支一扶”大学生的服务岗位、住宿以及安全、健康、卫生等后勤保障，帮助解决其遇到的困难和问题，并对服务单位的日常管理和服务工作进行监督和检查; 服务单位要负责为“三支一扶”大学生安排工作岗位，提供必要的生活条件，承担起日常管理和服务工作，并根据工作需要提供培训机会; 县（市、区）团委要在每个接收“三支一扶”大学生的乡镇择优选拔1名符合条件的大学生兼任乡镇团委副书记，并负责协调落实相关任职手续。“三支一扶”大学生应遵纪守法，服从安排，虚心学习，联系群众，自觉遵守服务单位的各项规章制度，充分运用掌握的知识和技能为基层群众服务。
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